Trường hợp của bạn, tôi nghĩ sẽ được cấp đổi lại GCNQSDĐ và việc xác định diện tích đất ở sẽ tuân theo qui định tại khoản 4 điều 87 Luật đất đai. Tại khoản này có 3 điểm là a, b và c, bạn cố gắng "ngoại giao" để được giải quyết theo điểm a là có lợi nhất.

Nguyên văn điểm a khoản 4 điều 87 Luật đất đai 2003 :

4. Đối với trường hợp thửa đất ở có vườn, ao được hình thành từ ngày 18 tháng 12 năm 1980 đến trước ngày Luật này có hiệu lực thi hành và người đang sử dụng có một trong các loại giấy tờ về quyền sử dụng đất quy định tại các khoản 1, 2 và 5 Điều 50 của Luật này mà trong giấy tờ đó không ghi rõ diện tích đất ở thì diện tích đất có vườn, ao được xác định như sau:
a) Uỷ ban nhân dân tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương căn cứ vào điều kiện, tập quán tại địa phương quy định hạn mức công nhận đất ở theo số lượng nhân khẩu trong hộ gia đình;

Ngoài ra, để thực hiện điều tôi vừa nói, ngày 28/01/2008, UBND TP Đà Nẵng nơi bạn cư trú có ra Quyết định số 08/2008/QĐ-UBND về việc Quy định hạn mức giao đất ở, hạn mức công nhận đất ở đối với thửa đất ở có vườn, ao cho mỗi hộ gia đình, cá nhân trên địa bàn thành phố Đà Nẵng. Vì bạn không cho biết cụ thể bạn ở Phường nào, Quận nào của TP Đà Nẵng nên tôi không trả lời chính xác được diện tích được xác nhận đất ở của bạn là bao nhiêu. Bạn vui lòng tra cứu theo Quyết định mà tôi vừa nêu sẽ biết rõ.

Riêng chuyện tiền sử dụng đất khi chuyển mục đích từ đất vườn, ao thành đất ở thì có qui định rõ tại điểm a khoản 2 điều 5 Nghị định 17/2006/NĐ-CP :" "a) Chuyển từ đất vườn, ao trong cùng thửa đất có nhà ở thuộc khu dân cư không được công nhận là đất ở sang làm đất ở thì thu tiền sử dụng đất bằng 50% chênh lệch giữa thu tiền sử dụng đất tính theo giá đất ở với thu tiền sử dụng đất tính theo giá đất nông nghiệp;"
Ví dụ giá đất ở tại địa phương bạn là 1 triệu/ m2, còn đất nông nghiệp là 200 ngàn/ m2 thì khi chuyển mục đích sử dụng từ đất vườn, ao sang đất ở bạn phải đóng tiền sử dụng là : 1 triệu - 200 ngàn x 50% = 400 ngàn/m2.
Lưu ý : giá đất ở và đất nông nghiệp là theo bảng giá đất mà UBND Tỉnh ban hành hàng năm vào ngày 01/01, chứ không phải giá thị trường. Vậy phần còn lại bạn tự tìm hiểu giá đất ở địa phương mình mà tính toán để biết chính xác nhé, vì tôi đâu có biết cụ thể bạn ở Quận nào của TP Đà Nẵng mà tính dùm bạn được.
Trân trọng.