Trường hợp này có thể CSGT nghi ngờ nguồn gốc xe của bạn thôi (vì xe mang biển số HN mà lại chạy ở Điện Biên nên bị nghi ngờ là phải) bạn lại không phải là người trực tiếp đứng tên xe nên CSGT càng có lý do để nghi ngờ, nếu bạn chứng minh được nguồn gốc của chiếc xe thì họ sẽ trả lại giấy tờ cho bạn và không phạt hành chính đó thôi.

Việc tạm giữ giấy tờ của bạn nằm trong nghiệp vụ quản lý của họ, việc này cũng nhằm bảo vệ quyền, và lợi ích của chủ xe mà thôi. Biên bản họ lập và giao cho bạn 1 bản cũng có giá trị pháp lý như Giấy đăng ký xe mà họ tạm giữ của bạn, nếu bạn tiếp tục bị CSGT kiểm tra hành chính, bạn có thể xuất trình Biên bản đó thay cho Giấy đăng ký xe.

Trường hợp này bạn không thể làm Đơn khiếu nại được, vì chỉ khi có "Quyết định hành chính" sai luật bạn mới có thể khiếu nại, còn CSGT mới chỉ lập Biên bản thôi, chưa phải là "Quyết định hành chính".

Đó chỉ là ý kiến cá nhân của mình thôi, mong được đóng góp thêm!